Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Utp11Q9CZJ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp11Q9CZJ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms