Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt88Q9CPR6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt88Q9CPR6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms