Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLSTN3Q9BQT9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN3Q9BQT9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN3Q9BQT9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms