Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lims1Q99JW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lims1Q99JW4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms