Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc1bQ920F6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc1bQ920F6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms