Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKIN2Q8WXE0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms