Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM58Q8NG06 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM58Q8NG06 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms