Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VITQ6UXI7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VITQ6UXI7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VITQ6UXI7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms