Protein–RNA interactions for Protein: Q61312

Tfap2c, Transcription factor AP-2 gamma, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2cQ61312 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfap2cQ61312 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2cQ61312 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms