Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf4Q60793 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms