Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
CCDC18Q5T9S5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CCDC18Q5T9S5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC18Q5T9S5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms