Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms