Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trpm1Q2TV84 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms