Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNA1EQ15878 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1EQ15878 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1EQ15878 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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