Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDGFRLQ15198 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRLQ15198 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms