Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 PDE1YGL248W 1110 nt4.5□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 IRC25YLR021W 540 nt4.5□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 WHI4YDL224C 1950 nt4.5□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 MRE11YMR224C 2079 nt4.5□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 IML2YJL082W 2196 nt4.5□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 HOF1YMR032W 2010 nt4.5□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 JIP5YPR169W 1479 nt4.49□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 YND1YER005W 1893 nt4.49□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 ECM4YKR076W 1113 nt4.49□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 ENV9YOR246C 993 nt4.49□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 ALG5YPL227C 1005 nt4.49□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 TIM12YBR091C 330 nt4.49□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 HOS2YGL194C 1359 nt4.49□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 APM1YPL259C 1428 nt4.48□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 PHO86YJL117W 936 nt4.48□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 MAC1YMR021C 1254 nt4.48□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 TOM40YMR203W 1164 nt4.48□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 SKP2YNL311C 2292 nt4.48□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 LAP2YNL045W 2016 nt4.48□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 PHM8YER037W 966 nt4.47□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 BMH1YER177W 804 nt4.47□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 PDR16YNL231C 1056 nt4.47□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 MRPL51YPR100W 423 nt4.47□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 STP22YCL008C 1158 nt4.47□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 SLD2YKL108W 1362 nt4.47□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 THI7YLR237W 1797 nt4.47□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 RSC1YGR056W 2787 nt4.47□□□□□ -1.69
SLM3Q12093 AIR1YIL079C 1083 nt4.46□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 SPC42YKL042W 1092 nt4.46□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 ATG8YBL078C 354 nt4.46□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 CAT5YOR125C 702 nt4.46□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 YPR150WYPR150W 522 nt4.46□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 snR32snR32 188 nt4.46□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 UBX5YDR330W 1503 nt4.46□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 CHD1YER164W 4407 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 PEX19YDL065C 1029 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 RRP1YDR087C 837 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 HOM2YDR158W 1098 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 SKI6YGR195W 741 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 YHR180WYHR180W 492 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 MOH1YBL049W 417 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 YOL035CYOL035C 303 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 FDH2YPL275W 711 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 DBF2YGR092W 1719 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 GCR2YNL199C 1605 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 TRS120YDR407C 3870 nt4.45□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 GCD14YJL125C 1152 nt4.44□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 RPS1BYML063W 768 nt4.44□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 GPI12YMR281W 915 nt4.44□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 NRM1YNR009W 750 nt4.44□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 COA2YPL189C-A 207 nt4.44□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 YNL095CYNL095C 1929 nt4.43□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 RSM10YDR041W 612 nt4.43□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 UBC6YER100W 753 nt4.43□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 GTR1YML121W 933 nt4.43□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 YOL079WYOL079W 399 nt4.43□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 YOR292CYOR292C 930 nt4.43□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 YNR063WYNR063W 1824 nt4.43□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 YDR132CYDR132C 1488 nt4.43□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 GIP1YBR045C 1920 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 BLM10YFL007W 6432 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 FAA1YOR317W 2103 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 MRPL25YGR076C 474 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 MRPL24YMR193W 777 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 RPC19YNL113W 429 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 MCK1YNL307C 1128 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 VHS3YOR054C 2025 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 EKI1YDR147W 1605 nt4.42□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 TRX3YCR083W 384 nt4.41□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 SPO12YHR152W 522 nt4.41□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 HMT1YBR034C 1047 nt4.41□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 MIS1YBR084W 2928 nt4.41□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 ALR2YFL050C 2577 nt4.41□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 DSF2YBR007C 2211 nt4.41□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 PTM1YKL039W 1572 nt4.4□□□□□ -1.7
SLM3Q12093 YGL108CYGL108C 423 nt4.4□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 MBB1YJL199C 327 nt4.4□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 PSF3YOL146W 585 nt4.4□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 VAS1YGR094W 3315 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 RPS16BYDL083C 432 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 DTD1YDL219W 453 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 PCL6YER059W 1263 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 DAM1YGR113W 1032 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 RPA43YOR340C 981 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 YPL014WYPL014W 1146 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 CBP1YJL209W 1965 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 NGL2YMR285C 1548 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 EXO5YBR163W 1758 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 NUG1YER006W 1563 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 MCX1YBR227C 1563 nt4.39□□□□□ -1.71
SLM3Q12093 MSR1YHR091C 1932 nt4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.8 ms