Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC8Q09428 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ABCC8Q09428 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ABCC8Q09428 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms