Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CluQ06890 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CluQ06890 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CluQ06890 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CluQ06890 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CluQ06890 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CluQ06890 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CluQ06890 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CluQ06890 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CluQ06890 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CluQ06890 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CluQ06890 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CluQ06890 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CluQ06890 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CluQ06890 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CluQ06890 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms