Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thbs2Q03350 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms