Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrkcqQ02111 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms