Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psme3P61290 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme3P61290 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme3P61290 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme3P61290 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms