Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ActbP60710 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ActbP60710 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ActbP60710 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ActbP60710 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ActbP60710 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ActbP60710 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ActbP60710 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ActbP60710 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ActbP60710 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ActbP60710 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ActbP60710 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ActbP60710 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ActbP60710 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ActbP60710 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ActbP60710 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ActbP60710 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ActbP60710 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ActbP60710 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ActbP60710 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ActbP60710 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ActbP60710 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ActbP60710 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms