Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsc2P56916 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms