Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA4P43681 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms