Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RYKP34925 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RYKP34925 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RYKP34925 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RYKP34925 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RYKP34925 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RYKP34925 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RYKP34925 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RYKP34925 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RYKP34925 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RYKP34925 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYKP34925 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYKP34925 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RYKP34925 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RYKP34925 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RYKP34925 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RYKP34925 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RYKP34925 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RYKP34925 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RYKP34925 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RYKP34925 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RYKP34925 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RYKP34925 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RYKP34925 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYKP34925 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYKP34925 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYKP34925 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYKP34925 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYKP34925 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYKP34925 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYKP34925 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYKP34925 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RYKP34925 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms