Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Twist1P26687 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Twist1P26687 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms