Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Klra1P20937 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Klra1P20937 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klra1P20937 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klra1P20937 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klra1P20937 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Klra1P20937 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klra1P20937 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms