Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM1P13688 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM1P13688 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms