Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pla2g4bP0C871 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pla2g4bP0C871 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pla2g4bP0C871 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms