Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa3P02831 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms