Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20918J3QN17 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20918J3QN17 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms