Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Igkv1-99F6XWB2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms