Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
1700113H08RikE9Q9Q5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700113H08RikE9Q9Q5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms