Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms