Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRAMEF22A3QJZ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms