Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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USP35Q9P2H5 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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