Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFDP1Q9UEE9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFDP1Q9UEE9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFDP1Q9UEE9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms