Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmQ9QXG2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChmQ9QXG2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms