Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A4Q9NY91 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A4Q9NY91 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A4Q9NY91 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms