Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASF1BQ9NVP2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms