Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV56

MRGBP, MRG/MORF4L-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRGBPQ9NV56 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRGBPQ9NV56 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRGBPQ9NV56 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms