Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATG3Q9NT62 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG3Q9NT62 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms