Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD3Q9H7E2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TDRD3Q9H7E2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms