Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SENP3Q9H4L4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SENP3Q9H4L4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SENP3Q9H4L4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms