Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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HOXD1Q9GZZ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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HOXD1Q9GZZ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXD1Q9GZZ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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HOXD1Q9GZZ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD1Q9GZZ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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