Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp27a1Q9DBG1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp27a1Q9DBG1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms