Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shisa9Q9CZN4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms