Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms