Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZC3H12CQ9C0D7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12CQ9C0D7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12CQ9C0D7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms