Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL25A1Q9BXS0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms